Helgenomsekventering af patogener ved undersøgelse af fødevarebårne udbrud

(1)

I henhold til artikel 8, stk. 2, i direktiv 2003/99/EF skal den kompetente myndighed i en given medlemsstat undersøge fødevarebårne udbrud i samarbejde med de kompetente myndigheder, der er ansvarlige for at håndtere alvorlige grænseoverskridende trusler mod menneskers sundhed og disses konsekvenser, jf. Europa-Parlamentets og Rådets afgørelse nr. 2119/98/EF . Nævnte afgørelse blev ophævet ved Europa-Parlamentets og Rådets afgørelse nr. 1082/2013/EU , der senere blev ophævet ved og erstattet af Europa-Parlamentets og Rådets forordning (EU) 2022/2371 . Disse undersøgelser skal give oplysninger om den epidemiologiske profil, om de fødevarer, der kan være involveret, og om de mulige årsager til udbruddene samt omfatte passende epidemiologiske og mikrobiologiske undersøgelser.

(2)

Effektiviteten af og det tværsektorielle samarbejde mellem offentlige sundheds- og fødevaresikkerhedsmyndigheder i sådanne undersøgelser er afgørende for at begrænse virkningen af et udbrud på folkesundheden og for at minimere den økonomiske virkning forbundet med tilbagekaldelser og tilbagetrækning af usikre eller potentielt usikre fødevarer. Til dette formål er det nødvendigt hurtigt og pålideligt at identificere partier eller forsendelser indeholdende kontaminerede fødevarer samt årsagen til udbruddet.

(3)

Helgenomsekventering er en moderne molekylær analyseteknik til mikrobiologiske undersøgelser, der i høj grad faciliterer hurtig identifikation af klynger af mikroorganismer til støtte for de epidemiologiske undersøgelser. Den muliggør etablering af forbindelser mellem isolater af fødevarebårne patogener fundet i mennesker, fødevarer, dyr, foder og det dermed forbundne miljø ved undersøgelsen af udbrud.

(4)

For i væsentlig grad at facilitere undersøgelser af fødevarebårne udbrud og rettidig opdagelse af kilderne til disse udbrud bør det kræves, at medlemsstaterne indsamler isolater af Salmonella enterica, Listeria monocytogenes, Escherichia coli, Campylobacter jejuni og Campylobacter coli, der stammer fra fødevarer, dyr, foder og dermed forbundne miljøprøver fra fødevare- og foderstofvirksomheder og ved offentlig kontrol, hvis disse isolater er forbundne med eller formodes at være forbundne med et fødevarebåret udbrud. Det bør også kræves, at medlemsstaterne gennemfører helgenomsekventering af disse isolater.

(5)

Medlemsstaterne bør overføre resultaterne fra helgenomsekventering af isolater af disse patogener fra fødevarer, dyr, foder og det dermed forbundne miljø til Den Europæiske Fødevaresikkerhedsautoritet (EFSA) (»autoriteten«), der har udviklet et fælles One Health-system sammen med Det Europæiske Center for Forebyggelse af og Kontrol med Sygdomme (ECDC). Inden for One Health-systemet kan autoriteten sammenligne resultaterne fra helgenomsekventering af isolater af disse patogener, der er indsamlet i overensstemmelse med nærværende forordning, med resultaterne af helgenomsekventering af menneskelige isolater, der er kommunikeret til ECDC i overensstemmelse med artikel 13, stk. 3, litra d), i forordning (EU) 2022/2371. En sådan sammenligning muliggør identifikationen af kilden til et udbrud og af de påvirkede sendinger, når den anvendes i kombination med oplysninger fra epidemiologiske undersøgelser. Ved overførslen af resultaterne af helgenomsekventering til EFSA-autoriteten bør der inkluderes yderligere relaterede oplysninger, der er afgørende for undersøgelsen af fødevarebårne udbrud.

(6)

Medlemsstaterne og autoriteten bør gives tilstrækkelig tid til at tilpasse sig de nye krav til indsamling af isolater, der stammer fra fødevarer, dyr, foder og dermed forbundne miljøprøver, helgenomsekventering af disse isolater og overførslen af de relaterede oplysninger for at tilvejebringe de nødvendige tekniske anvendelser og finansielle midler. Kravene i nærværende forordning bør derfor begynde at finde anvendelse 18 måneder efter ikrafttrædelsesdatoen for nærværende forordning.

(7)

Foranstaltningerne i denne forordning er i overensstemmelse med udtalelse fra Den Stående Komité for Planter, Dyr, Fødevarer og Foder —